В 1941 году направлен на фронт из города Энгельса Саратовской области. На фронте старший лейтенант Козлов Василий Акимович командовал пулемётной ротой 106 отдельной бригады. В январе 1943 года проходил лечение в госпитале. 9 января 1943 года Козлов А.А. начальником сортировочно-эвакуционного госпиталя №1074 Ароновым города Арзамаса направлен в Батальон Выздоравливающих на 10 дней.
Последнее письмо с фронта получили 15 февраля 1943 года. В бою с немецко-фашистскими захватчиками пропал без вести в феврале 1943 года.