7 января 1942 года умер от тяжелого ранения в эвакоприемнике № 230. 17 января 1943 года посмертно награжден медалью «За Отвагу», которая была вручена его сестре в 1995 году. Захоронен Сергей Степанович на территории средней школы ст. Кантемировка Воронежской области.
Племянница Галина Баюкова